День добрый.
Я в свое время избавился от звуков в задней двери при проезде неровностей. Из передней части двери торчит пластиковый "штырь" который плотно входя в ответный паз при закрытии, фиксирует дверь даже от маленьких перемещений во время движения. На этом штыре есть "выпуклости/риски" которые со временем стираются и он уже не в полной мере выполняет свои функции. Повернул его на 180 градусов (работает видимо только та сторона что на улицу, на задней стороне они не стерты) и звук прекратился. На фотке как раз видны эти "выпуклости/риски", а до этого был полностью гладкий. Чтобы повернуть ничего откручивать не надо, просто захватить плоскогубцами и повернуть.
Конечно, причины посторонних звуков могут быть разные. Но по принципу от простого к сложному, думаю стоит попробовать и вам так сделать. Кстати проблема была только на правой двери, видимо от того что чаще ее открывают.
Если не поможет вот еще совет небольшой: проверять откуда скрипит/стучит удобно открыв водительскую дверь и пошевелив заднюю в закрытом положении за ее торец со стороны средней стойки.