Осмотри внимательно плюсовую клемму на аккумуляторе -там 3 провода -раз снимал аккумулятор, а до этого всё работало - то сначала надо искать простую причину, а простая причина -оторвалось там что-то , проверь массу - она под полкой аккумулятора находится.
бортовой компютер не управляет нави - это нави читает с него несколько сигналов. А раз проблема глобальная -скорее всего что-то с питанием, и питанием "большим" .... пока это первое, что приходит в голову. Если бы сломалась нави - то магнитола бы работала всё равно, их можно расцепить - магнитола будет работать как автономное устройство. Нави - автономно. а работает ли в это время монитор - если он под напряжением - это в принципе видно.
Далее будет-если СD навигация - то одно, DVD-другое.
И, наконец - машину в подпись, в своих данных - откуда ты. Иначе тяжело понять какая у тебя нави, и что лучше посоветовать и куда и к кому лучше обратиться.